Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms