Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EHD3Q9NZN3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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