Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms