Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX29P2Q8IUI4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms