Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms