Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ECM1Q16610 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ECM1Q16610 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ECM1Q16610 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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