Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSRP1Q08945 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSRP1Q08945 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms