Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BDH1Q02338 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms