Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTBN1Q01082 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms