Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RORCP51449 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RORCP51449 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RORCP51449 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RORCP51449 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms