Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYKP34925 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYKP34925 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYKP34925 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms