Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA2P17301 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms