Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms