Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLIC3O95833 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms