Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER1O15534 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER1O15534 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PER1O15534 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PER1O15534 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PER1O15534 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PER1O15534 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PER1O15534 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PER1O15534 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER1O15534 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER1O15534 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PER1O15534 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms