Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VGLL3A8MV65 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms