Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SNX13Q9Y5W8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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SNX13Q9Y5W8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX13Q9Y5W8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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