Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms