Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NDUFA12Q9UI09 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NDUFA12Q9UI09 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NDUFA12Q9UI09 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDUFA12Q9UI09 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms