Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms