Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCGF6Q9BYE7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms