Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms