Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF554Q86TJ5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms