Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDXQ7Z353 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms