Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSRP2Q16527 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms