Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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