Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFIXQ14938 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIXQ14938 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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