Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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