Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF143P52747 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF143P52747 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms