Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UTP11Q9Y3A2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UTP11Q9Y3A2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms