Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms