Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MIS18AQ9NYP9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIS18AQ9NYP9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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