Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms