Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms