Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPR78Q96P69 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms