Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 317.26■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-208ENST00000475808 868 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.222e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-202ENST00000367666 2022 ntTSL 23.55□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PRPF19-206ENST00000541371 943 ntTSL 311.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 57.75□□□□□ -1.177e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 226.48■■□□□ 1.834e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 216.74■□□□□ 0.274e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 515.27■□□□□ 0.034e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 313.93□□□□□ -0.184e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 311.98□□□□□ -0.494e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-206ENST00000527842 815 ntTSL 417.75■□□□□ 0.434e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-210ENST00000531636 1395 ntTSL 216.96■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.969e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PRKAA1-208ENST00000511248 668 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PRKAA1-203ENST00000397006 425 ntTSL 37.52□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 INCENP-204ENST00000528375 808 ntTSL 314.76□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 59.63□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.598e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.778e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FBXL6-209ENST00000530687 506 ntTSL 215.39■□□□□ 0.055e-14■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 515.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 29.61□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 CAMSAP1-210ENST00000493088 429 ntTSL 39.21□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 HEATR6-204ENST00000587003 3566 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 FANCL-209ENST00000470506 733 ntTSL 22.42□□□□□ -2.022e-10■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PKN3-202ENST00000483521 597 ntTSL 515.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 26.87□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-206ENST00000557086 727 ntTSL 214.68□□□□□ -0.064e-12■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-203ENST00000553375 633 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-12■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-205ENST00000557022 577 ntTSL 513.1□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.714e-12■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 ZFP36L1-202ENST00000439696 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-12■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.721e-11■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 314.4□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 410.16□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 28.84□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MDH1-208ENST00000454035 575 ntTSL 34.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 214.93□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 214.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 213.7□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 212.24□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 57.19□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 30.3
PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL19-203ENST00000577759 564 nt8.79□□□□□ -19e-10■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 NAA60-211ENST00000571798 555 ntTSL 27.64□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 CASC3-207ENST00000581849 580 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 CASC3-203ENST00000418132 1986 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 CASC3-210ENST00000584997 543 ntTSL 39.27□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 SPSB3-203ENST00000563705 876 ntTSL 518.22■□□□□ 0.513e-10■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 SPSB3-202ENST00000563668 1509 ntTSL 214.35□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 NPEPPS-216ENST00000530514 2092 ntTSL 26.93□□□□□ -1.36e-9■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 CKAP5-211ENST00000532321 586 ntTSL 44.14□□□□□ -1.755e-15■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 COPG1-206ENST00000512034 398 ntTSL 31.14□□□□□ -2.238e-9■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 WRAP73-203ENST00000419924 603 ntTSL 517.03■□□□□ 0.323e-12■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 WRAP73-205ENST00000465916 779 ntTSL 38.47□□□□□ -1.053e-12■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 STK11IP-207ENST00000466648 594 ntTSL 38.91□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 UTP4-215ENST00000569615 574 ntTSL 310.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 30.2
PRPF8Q6P2Q9 SF3B3-202ENST00000562722 881 ntTSL 211.23□□□□□ -0.611e-11■■■■■ 30.2
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1340.1 ms