Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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