Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFFO1Q0D2I5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms