Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX1P83916 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms