Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJA9P57773 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJA9P57773 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA9P57773 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms