Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TPRP12270 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TPRP12270 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TPRP12270 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms