Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV3-15P01624 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV3-15P01624 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms