Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCTN3O75935 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCTN3O75935 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms