Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DENRO43583 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DENRO43583 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DENRO43583 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DENRO43583 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms