Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms