Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms