Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCN1P1Q5VSP4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCN1P1Q5VSP4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms