Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC57Q2TAC2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms