Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms