Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms